Uno de los tres programas estratégicos de ASPS esta relacionado con la Incidencia en Políticas Públicas de Salud, convencidos que los cambios que se requieren en el actual sistema nacional de salud son estructurales y de carácter político, mas que técnicos. Esto significa, que son los partidos políticos representados en la Asamblea Legislativa, en el Poder Ejecutivo, entre ellos el Presidente de la Republica y el Ministro de Salud, quienes tienen que tomar decisiones políticas relacionadas con el rumbo que hay que darle a la salud en El Salvador. Ellos son los responsables de la situación calamitosa que tenemos al interior del sistema nacional de salud, particularmente en el sector público (Ministerio de Salud) y en el ISSS (Seguro Social). De Estas instancias gubernamentales y de sus decisiones políticas depende que se mejore la salud o que se siga deteriorando tal como ha quedado demostrado en los últimos años.